Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFNP31947 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFNP31947 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFNP31947 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFNP31947 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFNP31947 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFNP31947 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFNP31947 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFNP31947 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms