Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms