Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms