Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms