Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB9P28065 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB9P28065 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB9P28065 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB9P28065 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB9P28065 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB9P28065 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB9P28065 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB9P28065 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB9P28065 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB9P28065 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms