Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms