Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HRCP23327 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HRCP23327 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HRCP23327 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HRCP23327 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRCP23327 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HRCP23327 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRCP23327 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HRCP23327 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms