Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDSP20132 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDSP20132 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDSP20132 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms