Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME1P15531 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms