Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2AF1L5P0DN76 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms