Protein–RNA interactions for Protein: P0CAT3

TLX1NB, Putative TLX1 neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX1NBP0CAT3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TLX1NBP0CAT3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms