Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG5P05408 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG5P05408 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCG5P05408 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCG5P05408 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCG5P05408 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCG5P05408 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCG5P05408 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms