Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX4O95219 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX4O95219 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms