Protein–RNA interactions for Protein: O75387

SLC43A1, Large neutral amino acids transporter small subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A1O75387 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC43A1O75387 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC43A1O75387 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC43A1O75387 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC43A1O75387 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms