Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GMDSO60547 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GMDSO60547 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GMDSO60547 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GMDSO60547 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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GMDSO60547 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GMDSO60547 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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GMDSO60547 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GMDSO60547 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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