Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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ACSL4O60488 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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ACSL4O60488 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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ACSL4O60488 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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ACSL4O60488 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSL4O60488 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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