Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC034187.1-201ENST00000437047 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SNPHO15079 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SNPHO15079 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SNPHO15079 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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