Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRTO14522 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
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