Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F3O00716 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F3O00716 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
E2F3O00716 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms