Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP4-16G5E9R7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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