Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms