Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms