Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIP1Q9Y3R0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms