Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms