Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS3

DNAJB9, DnaJ homolog subfamily B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB9Q9UBS3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJB9Q9UBS3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms