Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

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Length 977 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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