Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP28Q9P2N2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms