Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms