Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms