Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms