Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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FOXQ1Q9C009 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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FOXQ1Q9C009 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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FOXQ1Q9C009 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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FOXQ1Q9C009 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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FOXQ1Q9C009 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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FOXQ1Q9C009 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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