Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RX6P-201ENST00000439119 468 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYRM4-207ENST00000480566 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP52-201ENST00000516219 250 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC089998.4-201ENST00000552532 459 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013452.2-201ENST00000557910 743 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC242988.1-201ENST00000611044 714 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CU638689.5-201ENST00000623892 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SATB1-AS1-242ENST00000627496 807 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008040.1-204ENST00000469301 1738 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL354892.3-201ENST00000586101 1630 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01934-205ENST00000435411 1771 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms