Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCD2Q9BXW9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms