Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms