Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms