Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms