Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms