Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms