Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD180Q99467 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD180Q99467 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD180Q99467 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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