Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms