Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAC3Q96MF2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAC3Q96MF2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms