Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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