Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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