Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms