Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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GTF3C6Q969F1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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GTF3C6Q969F1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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GTF3C6Q969F1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
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GTF3C6Q969F1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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GTF3C6Q969F1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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GTF3C6Q969F1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
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GTF3C6Q969F1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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