Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA6Q92908 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA6Q92908 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms