Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms