Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF128Q8TEB7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms