Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD53Q8N9V6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms