Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP26C1Q6V0L0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms